PhD, PU-PH, PharmD,
stephane.chevaliez@aphp.fr
Les activités du CNR des Hépatites Virales B, C et Delta se répartissent en 3 axes complémentaires qui couvrent largement les champs de la virologie des hépatites, de l'investigation technologique à la recherche clinique et translationnelle.
Ces axes sont :
Expertise technologique
Plusieurs évaluations de tests virologiques à visée diagnostique pour le VHC et le VHB ont été conduites en partenariat avec les industriels qui les développent. Ces évaluations ont concerné les techniques de biologie moléculaire adaptées à la détection et/ou la quantification de l'ARN du VHC et de l'ADN du VHB par PCR ou TMA en temps réel, ainsi que des techniques de typage des génomes viraux par hybridation inverse ou séquençage visant à identifier le génotype et le sous-type viral ou des mutations de résistance après analyse des séquences nucléotidiques (méthodes de séquençage direct, séquençage à haut débit). Le développement de méthodes diagnostiques alternatives (tests rapides d'orientation diagnostique) au prélèvement sanguin pour le dépistage et le diagnostic des hépatites virales est en plein essor.
Les trousses évaluées au cours de l'année 2016 sont présentées dans la tableau ci-dessous :
Trousse | Application | Fabricant |
Abbott RealTime HCV |
| Abbott |
Cobas Taqman HCV v2.0 | Roche | |
Architect HCV Ag | Abbott | |
OraQuick HCV test |
| OraSure |
First Response HCV Card | Premier Med Corp | |
Assure HCV |
| |
MultiSure HCV | ||
OraQuick HCV test | OraSure | |
Toyo HCV |
| |
Labmen HCV | ||
VERIS HBV | Détection-quantification de l’ADN du VHB | Beckman |
Aptima HCV Quant Dx | Détection-quantification de l’ARN du VHC | Hologic |
Aptima HBV Quant | Détection-quantification de l’ADN du VHB | Hologic |
Epidémiologie moléculaire
Le laboratoire de virologie, en collaboration avec l'équipe de recherche INSERM, a développé tous les outils de typage moléculaire et d'analyse des génomes du VHB et du VHC (PCR, clonage, séquençage classique et séquençage à haut débit, analyses génétiques et phylogéniques) nécessaires au volet virologie de nombreuses enquêtes épidémiologiques nationales en lien avec SpF.
Des exemples d'études sont présentés dans le tableau ci-dessous :
Etude ou enquête | Objectif principal |
Prevagay 2015 | Séroprévalence du VIH et des hépatites B et C auprès des HSH fréquentant les lieux de convivialité |
BaroTest | Enquête nationale de dépistage des hépatites B et C et du VIH par auto-prélèvement à domicile |
Afrobaromètre Santé | Prévalence des hépatites B et C et du VIH auprès des populations africaine et caribéenne d’Ile-de-France |
Recherche clinique et translationnelle
Études génotypiques et phénotypiques de la résistance des virus d'hépatites aux antiviraux
Performance of rapid diagnostic tests for the detection of anti-HBs in various patient populations
J Clin Virol. 2017
The New Aptima HCV Quant Dx Real-time TMA Assay Accurately Quantifies Hepatitis C Virus Genotype 1-6 RNA
J Clin Virol. 2017
Dried Blood Spots: A Tool to Ensure Broad Access to Hepatitis C Screening, Diagnosis, and Treatment Monitoring
J Infect Dis. 2016
New virologic tools for management of chronic hepatitis B and C
Gastroenterology 2012
Evaluation of a new random-access HBV DNA molecular assay: The VERIS HBV assay
J Clin Virol. 2017
Approaches for simplified HCV diagnostic algorithms
JIAS 2017
