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CNR – Laboratoire coordonnateur 


Les prélèvements peuvent être réceptionnés 7 jours/7, 24 heures/24 via l'accueil du département PDTI de l'hôpital Henri Mondor. Les demandes d'examens doivent être accompagnées d'une fiche de renseignement  dûment complétée et envoyée à l'adresse suivante :


CNR VIRUS DES HEPATITES B, C ET DELTA
DEPARTEMENT PREVENTION, DIAGNOTIC, TRAITEMENT DES INFECTIONS
ENTRESOL 1
GROUPE HOSPITALIER HENRI MONDOR
1, RUE GUSTAVE EIFFEL
94010 CRÉTEIL
Adresse mail sécurisée : CLIQUEZ ICI
 

CNR – Laboratoire associé 


Les prélèvements peuvent être réceptionnés 7 jours/7, 24 heures/24 via l'accueil du LBM de l'hôpital Avicenne. Les demandes d'examens doivent être accompagnées d'une fiche de renseignement  dûment complétée et envoyées à l'adresse suivante :

CNR VIRUS DE L’HEPATITE DELTA
HOPITAL AVICENNE
Réception commune des laboratoires
BATIMENT LAVOISIER, PORTE 17, 1ER ETAGE 
125 RUE DE STALINGRAD
93000 BOBIGNY
Adresse mail sécurisée : CLIQUEZ ICI

Le CNR accepte les prélèvements suivants : sérums frais et/ou décantés et congelés, plasmas frais et/ou décantés et congelés, les extraits d'ARN ou d'ADN congelés, ainsi que les DBS à température ambiante. Pour tout autre type de prélèvement, veuillez contacter le CNR.


Marqueurs virologiques disponibles

Le CNR dispose au laboratoire coordonnateur (Tableau n°1) et au laboratoire associée (Tableau n°2) de différentes techniques et automates pour la détection et la quantification de nombreux marqueurs sérologiques et moléculaires des virus d’hépatites B, C et delta, ainsi que pour le typage et l'évaluation de la sensibilité aux antiviraux.

Analyses virologiquesLaboratoire de virologie du GH Henri Mondor
VHBVHCVHD
Détection/quantification d’antigènes viraux
 
AgHBs : HBsAg Qual II, HBsAg Next Qual, HBsAg Quant sur Alinity i (Abbott), ou HBsAg ES sur VITROS ECiQ (QuidelOrtho)

AgHBe : LIAISON HBeAg sur LIAIS0N Analyzer

AgHBcr : Lumipulse G HBcrAg sur Lumipulse G600 II (Fujirebio)
AgC : HCV Ag sur Alinity i (Abbott) 
Détection/quantification d’anticorps
 
Anti-HBs : Anti-HBs sur Alinity i (Abbott) ou aHBs sur VITROS ECiQ (QuidelOrtho)

Anti-HBc Totaux : Anti-HBc II sur Alinity i (Abbott) ou aHBc sur VITROS ECiQ (QuidelOrtho)

Anti-HBc IgM : Anti-HBc M sur Alinity i (Abbott) ou HBc M sur VITROS ECiQ (QuidelOrtho)

Anti-HBe : LIAISON Anti-HBe sur LIAIS0N Analyzer
Anti-VHC : Anti-HCV, Anti-HCV Next sur Alinity i (Abbott) ou aHCV sur VITROS ECiQ (QuidelOrtho)Anti-VHD : LIAISON® XL murex Anti-HDV sur LIAIS0N Analyzer (DiaSorin) ou HDV Ab DIA.PRO (Diagnostic Bioprobes srl)
Détection/quantification d’acides nucléiques
 
ADN VHB : cobas HBV Test sur c5800 (Roche) ou Alinity m HBV sur Alinity m (Abbott) ou Xpert HBV Viral Load sur GeneXpert (Cepheid)ARN VHC : cobas HCV Test sur c5800 (Roche) ou Alinity m HCV sur Alinity m (Abbott) ou Xpert HCV Viral Load sur GeneXpert (Cepheid)ADN VHD : EurobioPlex HDV EBX-071 qRT-PCR (Eurobio Scientific) 
Génotypage
 
Gène P/S : Analyse phylogénique après amplification d’un fragment de 630 paires de bases et séquençage Sanger sur SeqStudio Genetic AnalyzerGène NS5B : Analyse phylogénique après amplification d’un fragment de 286 paires de bases et séquençage Sanger sur SeqStudio Genetic AnalyzerRégion R0 : Analyse phylogénique après amplification d’un fragment de 397 paires de bases et séquençage Sanger sur SeqStudio Genetic Analyzer
Détermination du profil de résistance aux antiviraux directs
 
Analyse du domaine RT du gène P après amplification d’un fragment de 630 paires de bases et séquençage Sanger sur SeqStudio Genetic AnalyzerAnalyse des gènes NS3, NS5A et/ou NS5B après amplification des régions d’intérêt et séquençage Sanger sur SeqStudio Genetic Analyzer 
Transmission viraleAnalyses génétique et phylogénique de plusieurs régions du génome viral (S, P et/ou C)Analyses génétique et phylogénique de plusieurs régions du génome viral (NS5B, Core, E1 et/ou HVR1) 

 

Tableau n°2 : Liste des différentes techniques ou tests sérologiques et moléculaires disponibles au laboratoire de virologie du GH Avicenne (CNR - Laboratoire associé)

Analyses virologiques

Laboratoire de virologie du GH Avicenne

VHBVHCVHD
Détection/quantification d’antigènes viraux

AgHBs : HBsAg Qual II, HBsAg Quant sur Alinity i (Abbott)

AgHBe : HBeAg sur Alinity i (Abbott)

  
Détection/quantification d’anticorps

Anti-HBs : Anti-HBs sur Alinity i (Abbott)

Anti-HBc Totaux : Anti-HBc II sur Alinity i (Abbott)

Anti-HBc IgM : Anti-HBc M sur Alinity i (Abbott)

Anti-HBe : Anti-HBe sur Alinity i (Abbott)

Anti-VHC : Anti-HCV Next sur Alinity i (Abbott)

Anti-VHD : LIAISON® XL murex Anti-HDV sur LIAIS0N XL (DiaSorin) ou HDV Ab DIA.PRO (Diagnostic Bioprobes srl)

Anti-VHD IgM : HDV IgM DIA.PRO (Diagnostic Bioprobes srl)

Détection/quantification d’acides nucléiquesADN VHB : Alinity m HBV sur Alinity m (Abbott)ARN VHC : Alinity m HCV sur Alinity m (Abbott)

ADN VHD : EurobioPlex HDV EBX-071 qRT-PCR (Eurobio Scientific) ;

Robogene 2.0 (Roboscreen) ; RealStar et AltoStar 1.5 (Altona Diagnostics)

GénotypageGène P/S : Analyse phylogénique après amplification d’un fragment de 810 paires de bases et séquençage Sanger sur SeqStudio Genetic Analyzer 

Région R0 : Analyse phylogénique après amplification d’un fragment de 397 paires de bases et séquençage Sanger sur SeqStudio Genetic Analyzer

Génome complet : Sanger, Nanopore

Détermination du profil de résistance aux antiviraux directsAnalyse du domaine RT du gène après amplification d’un fragment de 810 paires de bases et séquençage Sanger sur SeqStudio Genetic Analyzer