Les activités de détection
et quantification virales

La détection, généralement associée à la quantification des génomes viraux (ADN ou ARN du virus) constitue un élément essentiel du diagnostic direct en virologie. En effet, la présence du génome viral signe la multiplication du virus au niveau de son ou de ses organe(s) cible(s). Les méthodes de détection et de quantification des génomes viraux sont principalement fondées sur l'amplification de la cible (PCR pour "polymerase chain reaction" ou TMA pour "transcription-mediated amplification") ou sur l'amplification du signal (bDNA pour "branched DNA").

Analyses biologiques disponibles

La détection et la quantification des ARN ou des ADN viraux sont réalisées à l'aide de techniques automatisées.

ANALYSE	INDICATION	AUTOMATE	REACTIF
Détection-quantification de l’ADN du VHB (mesure de la charge virale)	Diagnostic et suivi de l’hépatite chronique B Suivi thérapeutique de l’hépatite chronique B	GeneXpert	Cepheid ref.MADGXHBV-VL-CE-10
		Cobas	Roche ref.4894570190
		m2000	Abbott ref.2G3490
Détection-quantification de l’ARN du VHC (mesure de la charge virale)	Diagnostic et suivi de l’hépatite aiguë ou chronique C Suivi thérapeutique de l’hépatite chronique C	m2000	Abbott ref.4J8690
		GeneXpert	Cepheid ref.MADGXHCV-VL-CE-10
		Cobas	Roche ref.5532264190
Détection-quantification de l’ARN du VIH (mesure de la charge virale)	Diagnostic de l’infection par le VIH Suivi thérapeutique de l’infection par le VIH	Cobas	Roche ref.5212294190
		GeneXpert	Cepheid ref.MADGXHIV-VL-CE-10
Détection-quantification de l’ARN du VHE (mesure de la charge virale)	Diagnostic des hépatites aiguës ou chroniques E	m2000	Altona ref.271013
Détection-quantification de l’ADN du CMV sur sang total (mesure de la charge virale)	Diagnostic de la primo-infection CMV Diagnostic de réactivation CMV Suivi thérapeutique de l’infection par le CMV	Rotor-Gene Q	Qiagen ref.4503363
Détection-quantification de l’ADN de l’EBV sur sang total (mesure de la charge virale)	Diagnostic de réactivation EBV Diagnostic de lymphoproliferation liée à l’EBV Suivi thérapeutique de l’infection par l’EBV	Rotor-Gene Q	Qiagen ref.4501363
Détection-quantification de l’ADN du virus BK sur urines ou sang total (mesure de la charge virale)	Suivi de greffés rénaux Diagnostic étiologique des cystites hémoragiques	Rotor-Gene Q	Qiagen ref.4514363
Détection-quantification de l’ADN du virus HHV6 sur sang total (mesure de la charge virale)	Diagnostic étiologique des fièvres/encéphalites de l’immunodéprimé	Rotor-Gene Q	Elitech ref.RTS036PLD
Détection qualitative de l’ADN d’HSV-1 et HSV-2	Diagnostic étiologique des encéphalites (HSV-1) et méningites (HSV-2)	StepOnePlus	Biomérieux ref.69-004B
Détection qualitative de l’ADN du VZV	Diagnostic étiologique des lésions vésiculeuses Diagnostic étiologique des méningites virales	StepOnePlus	Biomerieux ref.69-004B
Détection qualitative de l’ARN des Entérovirus	Diagnostic étiologique des méningites virales	GeneXpert	Cepheid ref.MADGXEV-100N-10
Détection qualitative de l’ADN d’HHV6 hors sang total (autres prélèvements)	Diagnostic étiologique des fièvres/encéphalites de l’immunodéprimé	Rotor-Gene Q	Elitech ref.RTS036PLD
Détection qualitative de l’ADN d’HHV8	Diagnostic étiologique de la maladie Kaposi, des lymphomes des séreuses, de la maladie de Castelman	Rotor-Gene Q	Elitech ref.RTS038PLD
Détection qualitative de l’ADN du Parvovirus B19	Diagnostic de la primo-infection a parvovirus B19 Diagnostic étiologique d’anémie chez les patients immunodéprimés Diagnostic étiologique d’anémie chez les patients atteints d'hémoglobinopathie	Rotor-Gene Q	Elitech ref.RTS070PLD
Détection qualitative de l’ADN des Adénovirus	Diagnostic étiologique des gastroentérites et des pneumopathies d’allure virale Diagnostic étiologique des infections sévères chez le patient immunodéprimé	StepOnePlus	Biomérieux ref.69-010B
Détection qualitative de l’ARN du virus Zika	Diagnostic étiologique d’une virose au retour de région d’endémie	Rotor-Gene Q	Altona ref.591013
Détections qualitatives multiples des génomes de virus respiratoires : virus respiratoire syncitial, metapneumovirus humain, rhinovirus/enterovirus, adenovirus, coronavirus, virus parainfluenza, virus influenza A (H1N1, H3N2) et B	Diagnostic étiologique des pneumopathies viral aiguës	Filmarray	Biomérieux ref. RFIT-ASY-0136
Détection qualitative de l’ARN du virus influenza (grippe) A	Diagnostic étiologique des pneumopathies viral aiguës	GeneXpert	Cepheid ref.MADGXFLU/RSV-CE-10
Détection qualitative de l’ARN du virus influenza (grippe) B		GeneXpert	Cepheid ref.MADGXFLU/RSV-CE-10
Détection qualitative de l’ARN du virus respiratoire syncitial		GeneXpert	Cepheid ref.MADGXFLU/RSV-CE-10
PCR qualitative Norovirus	Suspicion Gastroenterite virale	GeneXpert	Cepheid ref.MADGXNOV-CE-10