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    Stéphane CHEVALIEZ

   PhD, PU-PH, PharmD,
   stephane.chevaliez@aphp.fr


Recherche dans le cadre du CNR
des Hépatites Virales B, C et Delta


 

Thématique

Les activités du CNR des Hépatites Virales B, C et Delta se répartissent en 3 axes complémentaires qui couvrent largement les champs de la virologie des hépatites, de l'investigation technologique à la recherche clinique et translationnelle.

Ces axes sont :

  • Expertise technologique : développement, standardisation et évaluation de la performance intrinsèque et des indications des tests et des nouvelles technologies virologiques à visée diagnostique et de suivi thérapeutique des hépatites virales chroniques.
  • Epidémiologie moléculaire : épidémiologie moléculaire et surveillance des virus des hépatites B et C dans le cadre du CNR des Hépatites Virales B, C et delta. Nous assurons la partie virologique de nombreuses enquêtes épidémiologiques nationales en lien avec Santé publique France (SpF)
  • Recherche clinique et translationnelle : étude de la variabilité génétique naturelle et associée à la chimiothérapie antivirale des virus des hépatites B et C. L'échec thérapeutique et la résistance du VHB et du VHC aux molécules antivirales constituent une des principales thématiques du laboratoire et de l'équipe INSERM qui lui est associée, à la fois dans ses aspects cliniques et plus fondamentaux (étude des mécanismes moléculaires de l'efficacité et de l'échec des traitements antiviraux)

Expertise technologique

Plusieurs évaluations de tests virologiques à visée diagnostique pour le VHC et le VHB ont été conduites en partenariat avec les industriels qui les développent. Ces évaluations ont concerné les techniques de biologie moléculaire adaptées à la détection et/ou la quantification de l'ARN du VHC et de l'ADN du VHB par PCR ou TMA en temps réel, ainsi que des techniques de typage des génomes viraux par hybridation inverse ou séquençage visant à identifier le génotype et le sous-type viral ou des mutations de résistance après analyse des séquences nucléotidiques (méthodes de séquençage direct, séquençage à haut débit). Le développement de méthodes diagnostiques alternatives (tests rapides d'orientation diagnostique) au prélèvement sanguin pour le dépistage et le diagnostic des hépatites virales est en plein essor.

Les trousses évaluées au cours de l'année 2016 sont présentées dans la tableau ci-dessous :

Trousse

Application

Fabricant

Abbott RealTime HCV



Détection-quantification de l’ARN du VHC à partir de sang total déposé sur DBS

Abbott

Cobas Taqman HCV v2.0

Roche

Architect HCV Ag

Abbott

OraQuick HCV test







Détection des anticorps anti-VHC à l’aide de TROD

OraSure

First Response HCV Card

Premier Med Corp

Assure HCV


MP Diagnostics

MultiSure HCV

OraQuick HCV test

OraSure

Toyo HCV


Türklab

Labmen HCV

VERIS HBV

Détection-quantification de l’ADN du VHB

Beckman

Aptima HCV Quant Dx

Détection-quantification de l’ARN du VHC

Hologic

Aptima HBV Quant

Détection-quantification de l’ADN du VHB

Hologic

 

Epidémiologie moléculaire

Le laboratoire de virologie, en collaboration avec l'équipe de recherche INSERM, a développé tous les outils de typage moléculaire et d'analyse des génomes du VHB et du VHC (PCR, clonage, séquençage classique et séquençage à haut débit, analyses génétiques et phylogéniques) nécessaires au volet virologie de nombreuses enquêtes épidémiologiques nationales en lien avec SpF.

Des exemples d'études sont présentés dans le tableau ci-dessous :

Etude ou enquête

Objectif principal

Prevagay 2015

Séroprévalence du VIH et des hépatites B et C auprès des HSH fréquentant les lieux de convivialité

BaroTest

Enquête nationale de dépistage des hépatites B et C et du VIH par auto-prélèvement à domicile

Afrobaromètre Santé

Prévalence des hépatites B et C et du VIH auprès des populations africaine et caribéenne d’Ile-de-France

 

Recherche clinique et translationnelle

Études génotypiques et phénotypiques de la résistance des virus d'hépatites aux antiviraux



Membres de l'équipe

  • Nazim Ahnou, Ingénieur d'études hospitalier
  • Valérie Ortonne, Technicienne de laboratoire
  • Lila Poiteau, Technicienne de laboratoire
  • Alexandre Soulier, Ingénieur d'études hospitalier
  • Mélanie Wlassow, Technicienne d'étude clinique

Collaborations

  • AC33 : Hépatites : virologie, résistance, innovations biotechnologiques, ANRS
  • Francis Barin, CNR virus de l'immunodéficience humaine - CHU Tours
  • Emmanuel Gordien, Laboratoire associé : Hépatites delta - Hôpital Avicenne
  • Karine Lacombe, Hôpital Saint-Antoine
  • Syria Laperche, INTS, CNR risques infectieux transfusionnels
  • Maud Lemoine, St Mary’s hospital - Imperial College London
  • Richard Njouom, Institut Pasteur du Cameroun
  • Mohamed Zameer, St Mary’s hospital - Imperial College London